Łamigłówki w Biomutant są ogólnie dość proste, albowiem zawsze polegają na tym, by ułożyć w odpowiedni sposób dwa kolory: złoty i biały. Każdorazowo masz jednak ograniczoną pulę ruchów, możliwych do wykonania, by łamigłówkę rozwiązać. Aby ową pulę ruchów podnieść, podnoś atrybut Inteligencji. Dziesięć punktów inteligencji, to jeden dodatkowych ruch podczas wykonywania łamigłówek.