Podczas drugiego przechodzenia gry, jako android 9S, możemy poznać wydarzenia z prologu rozgrywające się podczas walki z Engelsem z jego perspektywy. Walka jest dużo mniej skomplikowana niż w przypadku 2B, lecz mimo tego warto skorzystać z kilku wskazówek aby uczynić ją jeszcze prostszą.

Wskazówki dotyczące walki:

• Pasek zdrowia Engelsa ubywa bardzo powoli podczas ataków działkiem więc warto chwilę poczekać na moment, w którym będziesz miał możliwość hakowania poszczególnych części giganta - nie potrwa to długo;
• Podczas gdy przeciwnik atakuje swoimi mechanicznymi ramionami, możesz podlecieć do jego głowy i trzymać się blisko niej, a wtedy Cię one nie dosięgną;
• Pierwszy etap hakowania obejmuje oba ramiona Engelsa oraz głowa, a gdy już osłabisz te partie pojawi się możliwość hakowania tułowia - wykonanie tej czynności zakończy pierwszą fazę walki;
• Walcząc za pomocą PODa w drugiej fazie walki trzymaj się blisko ciała 9S, blokuj celownik na przeciwnikach (przycisk L2) i wykańczaj ich po kolei działkiem - nie pozwól im się zbliżyć do ciała androida;
• Hakując w poszczególnych sekwencjach Twoim zadaniem jest zlikwidowanie dużej czarnej kropki za pomocą kursora - korzystaj z niego tak, jak byś sterował działkiem.

Fazy walki:

Pojedynek składa się z dwóch wyróżniających się faz i kilku mini-faz, ponieważ często będzie on zmieniał formę rozgrywki. W pierwszej fazie musimy atakować Engelsa sterując myśliwcem, unikać jego uderzeń i w międzyczasie hakować poszczególne części maszyny. W drugiej fazie, bronimy na przemian ciała rannego 9S za pomocą PODa z działkiem oraz tak, jak wcześniej, co jakiś czas hakujemy kolejne elementy przeciwnika. 

Typy ataków, 1 faza:

• Pchnięcia mechanicznymi ramionami do przodu - ciosy są wolne i łatwe do przewidzenia więc wystarczy odlecieć na bok, ewentualnie korzystać z uniku;
• Pionowe uderzenia mechanicznych ramion - porada identyczna jak w poprzednim przypadku;
• Strzelanie okrągłymi pociskami - gdy Engels odchyli ramiona do tyłu i zaświeci swoje oczy na czerwono, za chwilę wystrzeli pociski.

Przebieg, 2 faza:

Kolejna faza walki rozpoczyna się ekranem hakowania. 9S został strącony przez Engelsa i znajduje się na jego mechanicznym grzbiecie. Jest on ranny i ma uszkodzony system.

• Sterując kursorem w systemie 9S masz ograniczony czas (3 minuty) na ponowne uruchomienie oprogramowania androida - kieruj się kursorem w górę, a następnie wybierz lewe odgałęzienie ścieżki gdzie znajdują się się trzy jasne, kwadratowe ikonki podpisane “Visual System”, najedź na każdą z nich i przytrzymaj trójkąt (obraz się rozjaśni); następnie znów udaj się w górę i wybierz prawe rozgałęzienie z podobnymi ikonkami (podpisanymi “Vocal System” i powtórz czynność (przywróci to dźwięk); po chwili usłyszysz wołanie 2B i sekwencja się zakończy;
• Następne jako jako POD broniący ciała 9S będziesz musiał odpierać fale przeciwników: pierwsza - dwóch zwykłych, druga - dwóch zwykłych i jeden latający, trzecia - dwóch zwykłych i dwóch latających, czwarta - trzech zwykłych i dwóch latających, piąta - pięciu zwykłych; postępuj według wskazówek zawartych we wstępie wpisu;
• Po odparciu przeciwników Twoim zadaniem jest hakowanie trzech urządzeń na grzbiecie Engelsa - za każdym razem wskaże je kamera;
• Gdy w cutscenie 2B wyrwie Engelsowi mechaniczne ramię, Ty będziesz musiał następnie odeprzeć kolejne fale przeciwników za pomocą PODa: pierwsze trzy - dwóch zwykłych, trzecia - trzech zwykłych, czwarta - pięciu zwykłych; trzymaj się blisko ciała 9S i postępuj jak poprzednio
• Po wykonaniu wszystkich wymienionych kroków pojawi się cutscenka, w której 2B wykańcza bossa i nastąpi koniec walki.