Misja rozpoczyna się w lokacji The Bunker, stacji kosmicznej, w której rezyduje oddział androidów YoRHa, zaraz po tym jak po walce z pierwszym bossem 2B oraz 9S zdetonowali swoje czarne skrzynki. 

W pierwszej kolejności udaj się w prawo owalnym korytarzem, aż spotkasz androida 9S. Między bohaterami wywiąże się rozmowa, związana z tym, że 9S, przed detonacją wgrał pamięć 2B do głównego serwera, dzięki czemu po regeneracji mogła ona ją odzyskać. Sam towarzysz stracił część swojej więc pamięta jedynie wydarzenia poprzedzające ich pierwsze spotkanie. Po cutscence pojawi się przerywnik filmowy dotyczący samej fabuły, a zaraz po nim z pomocą 9S będziesz musiał ustawić rozmaite opcje interfejsu użytkownika. 

Gdy się z tym uporasz, 2B obudzi się w swojej kwaterze mieszkalnej (możesz tam skorzystać z łóżka by odpocząć i zapisać stan gry oraz z terminala między łóżkiem, a regałem z książkami, gdzie uzyskasz dostęp do sklepu. W sklepie kupisz przedmioty leczące, czasowe ulepszenia ataku lub obrony, czy też sprzedaż bądź kupisz elementy HUD’a. Po rozmowie z 9S dowiesz się, że musisz udać się do dowódcy.

Opuść kwaterę 2B i udaj się w prawo, aż dotrzesz do białych automatycznych drzwi, przed którymi na podłodze widnieje herb oddziału YoRHa. Wejdź tam i przejdź krótkim korytarzem, aż trafisz do obszernej sali z dużym ekranem. Zjedź windą lub zejdź schodami na parter. W pomieszczeniu znajduje się wiele androidów, z którymi możesz porozmawiać. Ciebie interesuje kobiecy android w długiej sukni, z czerwonym znacznikiem nad głową - to dowódca oddziału. Rozmowa z dowódcą rozpocznie misję Gathering Intel.