Najważniejszą zmianą w porównaniu z pierwszym Empire Earth jest sposób zarządzania terenem i surowcami naturalnymi. Każde zajmowane terytorium musi posiadać centrum. Ograniczona została ilość budynków danego typu… czyli nie będzie już sytuacji takich jak w części poprzedniej gdy w jednym mieście mieliśmy wiele Uniwersytetów a w kolejnym żadnego. Nie będzie też możliwości posiadania ogromnych armii w jednym miejscu, co wymusi na graczach bardziej strategiczne podejście do wojny. Aby pokonać wroga nie można stworzyć potężnej armii i posłać ją do walki. Tym razem trzeba szukać słabych punktów przeciwnika i wykorzystać je w taki sposób, który umożliwi nam zwycięstwo.

Walki w grze zostały w znaczącym stopniu zmienione przez co w części drugiej musimy bardzo uważnie dobierać oddziały. Nie możemy wysłać rycerza przeciwko kawalerii, ponieważ nasza grupka zostanie zgnieciona tak szybko, że nawet nie zdążymy zdążą powiedzieć W strzebrzeszynie chrząszcz brzmi w trzcinie.
Strategia i taktyka będą decydującym czynnikiem podczas walk.
Jednostek w Empire Earth 2 będzie cała masa, będą oddziały powietrzne, lądowe oraz morskie. Każda jednostka będzie posiadała właściwe tylko sobie cechy, które wykorzystane w mądry sposób przyniosą zwycięstwo.

Oprócz powyższych aspektów w grze poprawiono również dyplomację, zarządzanie oraz interfejs użytkownika. Wszystkie zmiany są na lepsze, i dzięki nim gra będzie o wiele ciekawsza, a obsługa łatwiejsza.