Aby rozpocząć drogę w kierunku fabryki, musisz udać się do Miejsca Ceremonii. Podejdź tam do dziwnego obiektu w centrum i wejdź z nim w interakcję. Połóż na piedestale Giant’s Chalice, czyli Kielich Giganta. Obserwuj następnie wydarzenia, a gdy będziesz mógł kontynuować, idź przed siebie. Po wyjściu z tunelu skorzystaj z maszyny, by zapisać postępy, po czym przejdź przez most, a potem idź w stronę fabryki Heisenberga.

W środku rozejrzyj się po okolicy, by znaleźć proch strzelniczy. Potem przejdź przez drzwi z lewej i po schodach na dół. Po chwili wejdziesz do kolejnego pomieszczenia. Przeszukaj je, a znajdziesz chemikalia oraz biurko zasłonięte kotarą. Wejdź z nią w interakcję, aby obejrzeć scenkę przerywnikową. Po niej musisz się zwrócić o 180 stopni i uciekać. Skończysz przy wejściu do szybu – wskocz do niego, a wylądujesz na czymś w rodzaju wysypiska.

Na dole idź przed siebie, szukając drabiny. Po drodze zbieraj oczywiście przydatne rzeczy, jak złom czy proch strzelniczy. Gdy wyjdziesz po drabinie, zlikwiduj kilka pokrak i zniszcz skrzynię (1600 Lei). Przejdź następnie przez niewielki tunel obok tejże skrzyni. Po wyjściu na górę, zerknij za siebie – będzie tam skrzynia (2100 Lei). Weź jej zawartość i idź przed siebie. W niewielkiej kanciapie z lewej będzie Duke oraz maszyna do pisania – skorzystaj z usług obu, nim pójdziesz dalej.

Po zakupach, idź przez podwójne drzwi obok. W czymś w rodzaju warsztatu znajdziesz proch strzelniczy.  Weź go i kontynuuj przez dziwne drzwi (zamek zniszcz nożem), likwidując dwie pokraki, które będą po drugiej stronie. Po przejściu przez krótki korytarz znajdziesz się w pomieszczeniu z podświetlonymi na zielono drzwiami. Naprzeciwko nich jest panel kontrolny, ale niestety brakuje w nim zasilania. Idź zatem po pobliskich schodach na dół.

Z kolejnych drzwi wyjdą pokraki, więc je sprzątnij i przeszukaj miejscówkę. Znajdziesz tu dwie skrzynie do zniszczenia (Naboje Wybuchające oraz 3000 Lei), a mając wszystko, idź przez drzwi. Wejdziesz w ten sposób do Odlewni. Rozejrzyj się po niej, a znajdziesz złom, chemikalia, maszynę odlewniczą oraz dziwny symbol na ścianie. Drzwi w odlewni są zamknięte, więc idź dalej po schodach. W kolejnym pomieszczeniu znów sprzątnij pokraki i otwórz szafeczkę wytrychem (żółty kwarc) – jeśli masz takowy. Następnie przeszukaj pomieszczenie, by zdobyć proch strzelniczy. Nic więcej tu nie ma, więc idź w jedynym możliwym kierunku.

W kolejnym pomieszczeniu będzie dziwna postać z czymś w rodzaju piły w ręce. Po lewej znajdziesz tu złom – zabierz go i kontynuuj. Za postacią z piłą jest niewielka kanciapa, a w niej skrzynia. Otwórz ją, by zdobyć Formę na Relief (Relief Form). Weź ją i wracaj do Odlewni. Gdy ożyje pokraka z piłą, staraj się strzelać świecący na czerwono przedmiot na jej tułowiu – rób to zaraz po ciosie, gdy przedmiot, swoiste serce, jest odsłonięty. Po wygranej otrzymasz Kryształowe Mechaniczne Serce (Crystal Mechanical Heart). Możesz je oczywiście sprzedać Duke’owi.

W odlewni zamontuj formę w maszynie i poczekaj chwilę. Za moment będziesz mógł wziąć Relief Konia (Relief of a Horse). Zrób to i zamontuj go na dziwnym symbolu na ścianie. Gdy to zrobisz, otworzy się tajne przejście. Idź nim przed siebie, uważając na pokrakę, która za moment się pojawi. Na końcu przejścia znajdziesz zamkniętą szufladę (amunicja Magnum) – otwórz ją wytrychem, jeśli chcesz, a potem przyjrzyj się tutejszym drzwiom. Jest na nich symbol konia, ale nie masz oczywiście odpowiedniego klucza. Zeskocz zatem przez krawędź na dół.

Po wylądowaniu, obróć się i zniszcz skrzynię (2100 Lei), po czym ostrożnie zmierzaj przed siebie, uważając na piły oraz przeciwników. Jak przejdziesz na drugą stronę, wejdź po drabinie do góry i weź złom. Następnie przejdź przez wąski tunel, skręć w lewo i przed siebie. Mijając drzwi do odlewni, otwórz je, co odblokuje skrót, po czym kontynuuj po schodach w dół. Naprzeciwko schodów jest ściana zaznaczona żółtym „X”. Możesz ją zniszczyć jakimś materiałem wybuchowym. Za ścianą znajdziesz amunicję do strzelby oraz skrzynię, w której będzie Mechaniczna Część (Cylinder).

Wejdź następnie do pomieszczenia z lewej i przeszukaj je. Będzie w nim skrzynia (Pociski Eksplodujące) oraz generator zapasowy – brakuje w nim niestety trybu, przez co nie jesteś w stanie go uruchomić. Znajdź więc schody prowadzące jeszcze niżej i skorzystaj z nich. Przeszukaj okolicę, by zgarnąć proch strzelniczy, a potem idź do góry po schodach. Zniszcz dwa świecące zamki, a wejdziesz do warsztatu. Znajdziesz w nim notatkę, mapę fabryki, proch strzelniczy oraz skrzynię z Formą Trybu (Cog Mold). Weź ją i przejdź przez pobliskie drzwi. Następnie do przodu i przez drzwi, które zaprowadzą cię do Odlewni – uważaj, bo ostatni Soldat z piłą ożyje. Pokonaj go, weź kryształ i wejdź do Odlewni.

Przy pomocy maszyny przygotuj tryb. Mając je, przejdź przez drzwi prowadzące do sołdatów w ścianie i potem skręć w lewo. Tryb umieść w awaryjnym generatorze. Idź następnie do przodu przez kratę, która się otworzyła przed Tobą. Nie spiesz się, bo pojawi się Soldat – pozbądź się go. Dopiero wtedy przejdź przez otwartą kratę. Zniszcz skrzynię (amunicja do pistoletu) i podążaj dalej ciemnym korytarzem – trzymaj się lewej, by znaleźć kolejną skrzynię (amunicja do snajperki). Potem zaś idź w przeciwną stronę – uważaj na Soldata. W pomieszczeniu z nim jest skrzynia (zioło) oraz proch strzelniczy (w szafce), a w małym pokoju obok jeszcze jedna (Flashbang). Mając wszystko, idź po schodach do góry.

Na pomoście pojawi się Soldat – sprzątnij go i rozejrzyj się po okolicy, by znaleźć pociski wybuchające – są na ziemi, nieopodal miejsca, w którym spadł Soldat. Przejdź wreszcie przez drzwi z pięcioma pieczęciami (zniszcz wszystkie), a znajdziesz się w kolejnym sporym obszarze. Z prawej będzie mina, a gdy ją weźmiesz, idź przed siebie. Zwróć uwagę na cewki na ścianie – możesz w nie strzelić, unieruchamiając Soldata – może się przydać za moment. Jak przejdziesz kawałek, pojawią się pokraki. Sprzątnij je i idź dalej. Trzymaj się lewej, a znajdziesz skrzynię (amunicja do strzelby) oraz minę w szafce. Potem do przodu i po schodach do góry.

Nagle spadnie kontener, a z jego środka wyjdzie Soldat. Nie zabijaj go. Zamiast tego zagoń go do niewielkiej zatoczki z prawej strony schodów. Skubaniec zniszczy kratę i będziesz mógł pozbierać nieco przydatnych rzeczy (sporo Lei oraz amunicję Magnum). Oczywiście pozbądź się wreszcie Soldata, a potem przejdź przez kontener, by zdobyć amunicję do strzelby. Zniszcz następnie pieczęcie na drzwiach i przejdź przez nie.

Niezależnie od tego czy wrócisz do Duke’a czy nie, podejdź do konsoli w pomieszczeniu za drzwiami z pięcioma pieczęciami i aktywuj ją. Zjedzie w ten sposób pomost, po którym dostaniesz się do drzwi naprzeciwko (zwróć uwagę, że nad drzwiami coś połyskuje – strzel, by zdobyć żółty kwarc). Przejdź przez nie i do przodu, uzupełniając zapasy – m.in. proch strzelniczy, amunicja do strzelby (w szufladzie) oraz amunicja do snajperki w skrzyni.

W kolejnym małym pomieszczeniu nic nie ma – są jednak cewki, unieruchamiające wrogów, więc bądź pewny, że są w pobliżu. Zbliż się nieco, a wyjdzie Super Soldat – ten z dwoma piłami i z „sercem” na plecach. Strzel w cewki, by go unieruchomić, a potem ostrzelaj jego plecy. Po wygranej, idź dalej przez drzwi z pięcioma pieczęciami. Przejdź przez nie, a zaatakuje cię przeciwnik ze śmigłem – skieruj się wtedy w lewo i biegnij pod rurami. Otwórz niebieskie drzwi, a będziesz bezpieczny. W niewielkim pomieszczeniu znajdziesz dwa razy złom oraz proch strzelniczy. Weź to i idź dalej.

Na pomoście skieruj się do drabiny. Pociąg za dźwignię obok mapy, a przywołasz windę, w której jest Duke – możesz skorzystać z jego usług i zapisać postępy. Następnie zajmiemy się dokładniejszą eksplorację kolejnego poziomu fabryki, a konkretniej poziomu B3.