Misja Situs Inversus toczy się na japońskiej wyspie Hokkaido. Obszar ten to cztery kondygnacje, wchodzące w skład wyjątkowego ośrodka Gama. Jest w nim między innymi prywatny szpital, w którym przebywa Erich Soders - jedna z kluczowych postaci dla ICA, będąca jednocześnie celem Agenta 47. Drugim celem protagonisty jest natomiast Yuki Yamazaki - prawniczka współpracująca z Providence.

Poszczególne poziomy mapa ośrodka Gama na Hokkaido możesz zmieniać dzięki liście widniejącej pod Legendą, w prawym rogu mapy. Legenda służy natomiast do przeskakiwania pomiędzy znacznikami.