Wieża to ostatni rozdział The Callisto Protocol. Po krótkiej scence, która go zaczyna trafisz do celi. Wyjdź z niej i idź w prawo. Skrzynię, na którą natrafisz zostaw w spokoju i kontynuuj, aż znajdziesz Kuźnię. Skorzystaj z niej i idź dalej – droga jest w sumie jedna. Kieruj się do mrocznego przejścia z lewej, tam gdzie jest napisane Serwerownia. W pomieszczeniu z dymem uważaj, bo czeka Cię tam pojedynek z dwugłowym stworem. Taktyka walki jest dokładnie taka sama, jak wcześniej.

Pokonaj pokrakę, przeszukaj zwłoki i zerknij dookoła. W miejscu, w którym stał potwór jest panel, a w nim bezpiecznik. Weź bezpiecznik i wróć się do pomieszczenia, w którym była kuźnia. Jest tam niesprawny panel. Umieść w nim nowy bezpiecznik, a otworzą się drzwi i będziesz mógł kontynuować. Idź w jedyną możliwą stronę, a w długim korytarzu w lewo. Uważaj, bo natrafisz tam na potwory. Najpierw jeden wyskoczy z szybu, a potem drugi przez szybę.

Pokonaj obie pokraki i otwórz zamknięte drzwi, niszcząc panel obok nich. W nowym pomieszczeniu przeszukaj szafki, a gdy pójdziesz dalej przez szpital, przygotuj się na walkę z potworami. Najpierw wyskoczą tylko dwa, ale im dalej, tym więcej ich będzie. Skorzystaj z pomocy czołgających się potworów, by sprzątnąć pozostałych. Bo rzucenie nimi powoduje wybuchy. Po wygranej, zejdź po schodach i idź dalej. Tam też bądź gotowy do walki. Wygraj i kontynuuj. Ciągle walcz, korzystaj z otoczenia i pokonuj pokraki. Droga jest jedna, tyle że pełna niebezpieczeństw.

Po tym jak zejdziesz po drabinie, wyjdź na korytarz i kieruj się w lewo – uważaj na dwie pokraki. Pokonaj je i otwórz rękawicą szyb wentylacyjny, po czym wejdź do niego. Z drugiej strony, w jednym z pomieszczeń, znajdziesz bezpiecznik – jest przy ciele strażnika. Weź go i otwórz tutejsze drzwi przesuwne do pomieszczenia zwanego Psychiatryczny 1 A110. Trafisz do korytarza, z którego przyszedłeś. Na jego końcu są drzwi, przy których musisz wykorzystać bezpiecznik – zrób to i idź dalej. Z prawej dostrzeżesz Kuźnię i nieco surowców. Z lewej będą drzwi.

Przejdź przez drzwi, zostaw w spokoju skrzynię i idź dalej. Gdy wejdziesz do okrągłej sali, zachowaj ostrożność, bo zaczną się pojawiać pokraki. Gdy wejdziesz do dłuższego i szerszego korytarza, pojawi się dwugłowy. Cofnij się wtedy szybko do pomieszczenia, w którym jest maszyna i stół operacyjny. Dzięki temu nie pojawią się kolejne pokraki, a ty będziesz w stanie pokonać względnie spokojnie dwugłowego. Gdy to zrobisz, zbierz loot i ruszaj dalej, walcząc z kolejnymi potworami.

Trzymaj się lewej i przejdź przez drzwi. Odpuść przeszukiwanie skrzyni i brnij przed siebie, aż wejdziesz do laboratorium. Gdy przejdziesz przez drzwi na końcu odpali się scenka przerywnikowa. Po niej będziesz mógł kontynuować. Wejdź do windy i wjedź nią na wieżę. Na górze idź przed siebie. Droga jest jedna. Wreszcie zobaczysz kolejny przerywnik. Przejdź po nim przez drzwi i idź korytarzem do góry. Znajdziesz się w pomieszczeniu, w którym jest Kuźnia i nieco surowców. Skorzystaj z Kuźni, aby poprawić ekwipunek – wydaj wszystkie kredyty. Zbierz też amunicję. Otwórz następnie drzwi, przy których jest uszkodzony panel, a rozpoczniesz sekwencję prowadzącą Cię do walki z bossem.

Walka z bossem - kapitan Ferris, a potem Alfa

Pojedynek z finałowym bossem nie jest jakoś szczególnie skomplikowany. W pierwszym jego etapie, gdy pojedynkujesz się z kapitanem Ferrisem, rób po trzy uniki, a potem zadawaj obrażenia strzelając. Proces powtarzaj, aż kapitan odejdzie w zapomnienie.

W drugim etapie, w którym walczysz z potężną Alfą sytuacja wygląda nieco inaczej, choć nadal nie ma szaleństwa. Staraj się trzymać blisko potwora i poruszaj się raz w lewo, raz w prawo, by robić uniki. W przerwami pomiędzy unikami strzelaj w łeb potwora.

Gdy pokraka zacznie ryczeć, oddal się do jednego z korytarzy i rozejrzyj się dookoła. Zaczną bowiem wyłazić czołgające się potwory. Łap je rękawicą i miotaj w bossa. Każdorazowo pojawią się dwie czołgające się poczwary. Proces uników i strzelania, a potem miotania czołgającymi się potworami musisz w sumie powtórzyć trzy razy. Kontynuuj oczywiście uniki i strzelanie, aż odpali się przerywnik, co będzie oznaczało wygraną.

Po zwycięstwie obejrzysz scenkę przerywnikową. Gdy dobiegnie ona końca, musisz uciec z Black Iron, więc pędź przed siebie, aż obejrzysz kolejną scenkę – finałową. Jasno daje ona do zrozumienia, że deweloperzy przygotują kontynuację opowieści Jacoba.