Odrobina historii:
Pierwsza część przygód Agenta 47 rozpoczyna się od jego ucieczki z sanatorium, w którym został uwięziony. Pomaga mu w tym tajemnicza postać, niejako nadzorująca jego poczynania. Akcja następnie przenosi się rok do przodu, a protagonista jest wówczas członkiem agencji ICA, w której prowadzącym Agenta 47 jest kobieta o imieniu Diana Burnwood. Wysyła ona naszego mordercę na misje, mające na celu eliminację czterech bossów przestępczych, a potem także piątego, zwanego Doctor Kovacs. Przebywa on w sanatorium, w którym wcześniej znajdował się 47. W miarę postępów fabularnych, protagonista odkrywa, że wszystkie jego cele uczestniczyły w tajnym eksperymencie, związanym z klonowaniem. Wynikiem tegoż eksperymentu jesteśmy my sami, doskonała maszyna do zabijania.
Głównym antagonistą okazuje się profesor Ort-Meyer, który, czując zagrożenie, wysyła grupę klonów 48, mających za zadanie zlikwidowanie 47. Z pomocą innych agentów, protagonista eliminuje klony i zabija także samego profesora. Po wszystkim postanawia zaś zrezygnować ze swojej profesji, szukając spokoju w sycylijskim klasztorze. Zostaje jednakowoż zmuszony do pozostania w szeregach agencji, kiedy dowiaduje się, że jego mentor i przyjaciel, Ojciec Vittorio, został porwany. Wraca do ICA, umawiając się ze swoim pracodawcą, że będzie wykonywał dla niego kontrakty, pod warunkiem że otrzyma pomoc w odnalezieniu przyjaciela.
W miarę postępów fabularnych okazuje się, że w porwanie zamieszany był Sergei Zavorotko, brat jednego z mężczyzn, których DNA posłużyło do stworzenia Agenta 47. Człowiek ten postanawia zawrzeć umowę z Zavorotko, związaną z zakupem głowicy nuklearnej. Agent 47 wdziera się do klasztoru ojca Vittorio, zabija Zavorotko i wszystkich jego współtowarzyszów. Mimo że Vittorio prosi protagonistę o to, aby odpuścił i wrócił do klasztoru, ten postanawia zająć się w pełni pracą dla ICA.
Mijają kolejne lata, a Agent 47 powraca w ramach gry Hitman: Krwawa Forsa. Reputacja protagonisty dotarła we wszystkie strony świata. Ogromna liczba klientów korzysta z jego usług. W miarę postępów w grze bohater odkrywa, że ICA atakowane jest przez tajemniczą organizację, która postanawia zniszczyć reputację Agenta 47, podkładając dowody stawiające znaczek celiwnika na jego głowie. W sprawę zamieszany jest jeden z agentów ICA, Alexander Leland Cayne. Tajemnicza organizacja powoli wykańcza ICA, doprowadzając do sytuacji, w której w jej szeregach pozostają wyłącznie Diana oraz Agent 47. Intryga się zacieśnia, a protagonista musi spróbować rozwiązać kryzys.
Kilka lat później po wydarzeniach z Krwawej Forsy rozgrywa się akcja Hitman: Rozgrzeszenie. Tłem wydarzeń jest tutaj rzekoma zdrada Diany, która skazuje ICA na wzrok opinii publicznej. Agencja dowiaduje się o jej zdradzie, wysyłając swoich pracowników, mających za zadanie jej eliminację. Podczas jednej z misji Diana nagle opuszcza Agenta 47, co prawie skutkuje jego śmiercią. W wyniku tego 47 decyduje się zerwać wszelkie kontakty z ICA i spróbować znaleźć rozwiązanie kryzysu samodzielnie.
