W grze wcielamy się w postać Gordona Freemana, młodego naukowca, doktora fizyki teoretycznej. Bohater pracuje nad tajnym projektem w instytucie Materiałów Anormalnych w tajnej bazie Black Mesa, zlokalizowanej gdzieś na pustyni w stanie Nowy Meksyk. Gordon bierze udział w eksperymencie, który kończy się katastrofą z powodu awarii. Skutkiem owej katastrofy jest przypadkowe otwarcie portali do świata Xen skąd do bazy zaczynają przybywać hordy obcych. Podczas gry, Gordon od czasu do czasu spotyka tajemniczą postać - człowieka w ciemnym garniturze z walizką w ręku - wśród fanów gry, znaną jako G-Man. Ten nieuchwytny człowiek, wydaje się śledzić postępy Freemana podczas jego walki o przetrwanie w Black Mesa.
PodglądBICodeURLIMGCytatSpoiler