(Patrz: Zneutralizuj wyrzutnię rakiet dalekiego zasięgu) Po zneutralizowaniu tarczy ochronnej wyrzutni rakiet dalekiego zasięgu, do aktywowanych dodatkowych zadań dołączy nowa, dodatkowa misja.

W niej naszym zadaniem jest namierzenie i zniszczenie punktów kontrolnych milicji, sprawujących kontrolę nad terytorium Gotham. Łącznie jest ich aż 20 i każdą musimy odkryć samodzielnie:

• 8 punktów kontrolnych na wyspie Miagani Island
• 4 punkty kontrolne na wyspie Bleake Island
• 8 punktów kontrolnych na wyspie Founders’ Island