Inside przedstawia nam losy chłopca, który, przemierzając las, trafia w sam środek dziwnego ośrodka badawczego. Nie sposób określić jak chłopiec się do niego dotarł i skąd znalazł się w jego pobliżu, pewne jest natomiast, że na terenie ośrodka panuje zakaz wstępu, a w związku z tym młodzieniec znalazł się w nie lada tarapatach.

Fabuła opowiadana jest za sprawą lokacji oraz tego, co dzieje się na ekranie. Początkowo znajdujemy się w lesie, w miarę postępów trafiamy jednak także na farmę, budowę oraz do miasta. Finalnie natomiast docieramy do ośrodka, aby dowiedzieć się czym zajmują się zatrudnieni tam ludzie. Po drodze musimy pokonać jednak wiele niebezpieczeństw, nie zawsze związanych ze strażnikami. Często są one wynikiem prowadzonych w okolicy badań.

Zakończenie poddać należy własnej interpretacji. Jest ono bowiem co najmniej niejasne.