Minęło sto lat odkąd powierzchnia niegdyś zielonej planety całkowicie pokryła się radioaktywnymi odpadami i pozostałościami po naturalnej faunie i florze. Sto lat od wojny nuklearnej. 40 lat temu, w 2079 r. pierwsi ocaleni wyszli na skażoną powierzchnię, aby rozpocząć kolejny konflikt. Tym razem z krwiożerczymi atomowymi bestiami, które przystosowały się do post-atomowych warunków "życia". Rozgorzały konflikt jednak się nie zakończył. Historia lubi się powtarzać i także tym razem zatacza koło, aby ponownie postawić naprzeciw sobie resztki ludzkości i wielką pomyłkę natury żądną krwi. Obie strony zdążyły się częściowo odbyć rekonwalescencję, ale była to tylko cisza przed burzą, która właśnie się rozpętała. Na domiar złego jakby znikąd przybywa armia robotów Serii 9. Bez uczuć, bez strachu przed napromieniowaniem niszczą one wszystko obracając wypaloną już ziemię w jeszcze drobniejszy pył.

Kampania dla pojedynczego gracza zawiera teraz więcej, bo 51 misji. Weterani pierwszej części dostrzegą kilka nowych usprawnień. Między innymi mosty i fortyfikacje mające strategiczne znaczenie. Ponadto wojna ma miejsce także na terenach górzystych, gdzie ograniczona widoczność idzie w parze z brakiem możliwości swobodnego poruszania się. Nie zabrakło także nowych jednostek, w tym latających będącymi świetnym uzupełnieniem dla piechoty oraz pojazdów. Po 100 latach technologia także przeszła lekki renesans, co zaowocowało np. pojawieniem się w bazach radarów. Występowanie trzech ras stwarza także możliwość obrania taktyki unikalnej dla każdej strony, a zarazem całkowicie skutecznej przeciwko przeciwnikom. Obecność trzech ras sprawia, iż potyczki mogą być tutaj swoistą zabawą "kamień, nożyce, papier", gdzie nie ma faworyzowanej strony.

Nie zabrakło także trybu multiplayer na 20 mapach dla maksymalnie ośmiu graczy.